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La distinction entre champignons parasites et saprophytes n’est pas toujours tranchée : il n’est pas rare que des champignons soient parasites pendant une partie de leur cycle biologique et saprophytes (sur les débris de l’hôte ou dans le sol) pendant une autre partie (parasites facultatifs).— (Philippe Lepoivre, Phytopathologie, Éditions De Boeck Université, 2003, page 129 → lire en ligne)
D'autres champignons, les nécrotrophes, sont des saprophytes facultatifs. Ils peuvent se développer en tant que parasite sur les hôtes, puis continuer à vivre, croître et se multiplier sur les tissus morts de l'hôte après sa mort.— (A. Le Ralec, V. Le Féon & al, « Caractéristiques écologiques des organismes impliqués dans la régulation naturelle et la pollinisation », part. 2 : chap. 6 de Paysage, biodiversité fonctionnelle et santé des plantes, sous la coordination de Sandrine Petit & Claire Lavigne, Éditions Quae/ Educagri Éditions, 2019, p. 95)
Note : bien que l'usage en mycologie retienne le terme saprophyte, il serait plus juste étymologiquement parlant d'utiliser l'hyperonymesaprobionte.
Le grand intérêt de la solarisation réside dans cette stimulation de la microflore saprophyte épargnée par l’élévation de la température.— (Pierre Davet, Vie microbienne du sol et production végétale, INRA Éditions (Quae), 1996, page 303)
À côté des Triuris, on trouve une plante connue exclusivement au Japon, Japonelirion, ancienne également saprophyte, qui est estimée à 110 millions d'années.— (Yves Michaud, Qu'est-ce que la diversité de la vie ?, 2006)
Leurs feuilles minuscules, sans chlorophylle, de couleur grise, sont incapables de pratiquer la photosynthèse ; recevant leur alimentation des champignons symbiotes qu'elles hébergent dans leurs parties souterraines, ces plantes surprenantes, appartenant aux genres Voyria et Leiphamos, sont des Gentianaceae saprophytes.— (Francis Hallé, Eloge de la plante. Pour une nouvelle biologie, 2015)
Bien que l’état symbiotique demeure essentiel à la survie de ces champignons en nature, on reconnaît maintenant qu'ils conduisent également une certaine activité saprophyte, on parle de mixotrophie.— (Yves Piché, J. André Fortin, Christian Plenchette, Les mycorhizes: L'essor de la nouvelle révolution verte, 2016, page 63)
C’est notamment le cas des orchidées saprophytes qui n’ont pas de feuilles ni de chlorophylle et qui se nourrissent uniquement à partir de l'humus du sol par l'intermédiaire du champignon. Sous nos climats, Neottia nidus-avis, la néottie nid-d’oiseau, Corallorbiza trifida ou racine corail, Epipogon aphyllum ou épipogon sans feuilles appartiennent à cette catégorie. Sous les tropiques, certains Eulophia sont aussi saprophytes et, récemment, un Habenariasaprophyte a été trouvé à Madagascar.— (Marcel Lecoufle, Le traité des orchidées, 2004, page 26)
