bioinformatics

Üdvözlöm, Ön a bioinformatics szó jelentését keresi. A DICTIOUS-ban nem csak a bioinformatics szó összes szótári jelentését megtalálod, hanem megismerheted az etimológiáját, a jellemzőit és azt is, hogyan kell a bioinformatics szót egyes és többes számban mondani. Minden, amit a bioinformatics szóról tudni kell, itt található. A bioinformatics szó meghatározása segít abban, hogy pontosabban és helyesebben fogalmazz, amikor beszélsz vagy írsz. Abioinformatics és más szavak definíciójának ismerete gazdagítja a szókincsedet, és több és jobb nyelvi forráshoz juttat.

Angol

Főnév

bioinformatics (tsz. bioinformaticses)

  1. (informatika) bioinformatika

Bioinformatics (bioinformatika) az informatika, a biológia, a matematika és a statisztika határterülete, amely a biológiai adatok – főként DNS, RNS, fehérje szekvenciák és struktúrák – számítógépes elemzésével foglalkozik. Célja a biológiai rendszerek megértése, modellezése, és új ismeretek felfedezése adatvezérelt módon.


🧠 1. Mi a bioinformatika?

Definíció:

Bioinformatika: biológiai problémák megoldása számítógépes eszközökkel és algoritmusokkal.

Ez magában foglalja:

  • Adatok gyűjtését (pl. szekvenálás)
  • Tárolását (adatbázisok)
  • Elemzését (szekvencia-illesztés, génkeresés)
  • Értelmezését (fehérjestruktúra, hálózatelemzés)


🧬 2. Főbb alkalmazási területek

Terület Leírás
Genomika Teljes genomok elemzése, génazonosítás
Transcriptomika RNS expresszió, alternatív splicing
Proteomika Fehérjék szerkezete, funkciója, kölcsönhatása
Metabolomika Anyagcsere utak vizsgálata
Filogenetika Evolúciós kapcsolatok vizsgálata
Számításos rendszerszintű biológia Biológiai hálózatok modellezése
Személyre szabott orvoslás Genetikai profil alapján történő gyógyszertervezés
Drug discovery Molekulamodellezés, gyógyszercélpontok előrejelzése


📦 3. Alapvető bioinformatikai feladatok

✅ 3.1 Szekvencia-illesztés

  • Két vagy több DNS/RNS/fehérje szekvencia összehasonlítása
  • Eszközök: BLAST, Clustal Omega

✅ 3.2 Motívumkeresés

  • Funkcionális mintázatok keresése DNS-ben (pl. promoterek)

✅ 3.3 Filogenetikus faépítés

  • Evolúciós kapcsolatok modellezése (pl. neighbor-joining, maximum likelihood)

✅ 3.4 Fehérjestruktúra előrejelzés

  • Szekvenciából térbeli szerkezet előrejelzése (pl. AlphaFold)

✅ 3.5 Génexpresszió-analízis

  • RNA-seq adatok statisztikai feldolgozása
  • Eszközök: DESeq2, edgeR


🧰 4. Eszközök és nyelvek

Nyelv/eszköz Használat
Python Általános elemzés (pl. Biopython, scikit-bio)
R/Bioconductor Statisztikai genomikai elemzés
Perl Régebbi szkriptelésre használt
BLAST Hasonlóság-keresés
Clustal Többszörös szekvencia-illesztés
GROMACS/ROSETTA Fehérje modellezés és dinamika
Galaxy Online bioinformatikai workflow rendszer
IGV Genomvizualizáció


🧬 5. Fontos adatbázisok

Név Tartalom
NCBI Genom, fehérje, publikációk
ENSEMBL Genom-adatbázis, főként eukarióták
UniProt Fehérjeszekvenciák és annotációk
PDB Fehérjestruktúrák
GEO Génexpressziós adatok
KEGG Anyagcsere- és jelátviteli utak
ClinVar Patogén variánsok és betegségek


🔬 6. Példa: DNS GC-tartalom kiszámítása Pythonban

from Bio.Seq import Seq

seq = Seq("ATGGCGGCCATTTACCG")
gc_count = seq.count("G") + seq.count("C")
gc_content = 100 * gc_count / len(seq)

print(f"GC-tartalom: {gc_content:.2f}%")

📈 7. Bioinformatika és mesterséges intelligencia

  • Gépi tanulás segíti a:
    • Betegségpredikciót
    • Fehérjefunkció-becslést
    • Fehérjestruktúra előrejelzést (pl. AlphaFold)
  • Deep learning alkalmazható:
    • Szekvencia osztályozásra (CNN, RNN)
    • Génregulációs elemek felismerésére


🧾 8. Összefoglalás

Fogalom Leírás
Bioinformatika Biológiai adatok számítógépes elemzése
Fő adatok DNS, RNS, fehérje, génexpresszió, hálózat
Módszerek Szekvencia-illesztés, gépi tanulás, statisztika
Eszközök Biopython, BLAST, R, Galaxy
Adatbázisok NCBI, UniProt, PDB, ENSEMBL
Alkalmazások Orvoslás, evolúció, gyógyszertervezés

További információk

Enciclo
Wikious
Sapientia
Scientia
Boobota
Anandapedia
Sagapedia
Wikithot