On compte vingt acides aminés naturels. Ceux-ci sont désignés par :
Nom | 3 lettres | 1 lettre |
---|---|---|
alanine | Ala | A |
arginine | Arg | R |
asparagine | Asn | N |
aspartate ou acide aspartique | Asp | D |
cystéine | Cys | C |
glutamate ou acide glutamique | Glu | E |
glutamine | Gln | Q |
glycine | Gly | G |
histidine | His | H |
isoleucine | Ile | I |
leucine | Leu | L |
lysine | Lys | K |
méthionine | Met | M |
phénylalanine | Phe | F |
proline | Pro | P |
sérine | Ser | S |
thréonine | Thr | T |
tryptophane | Trp | W |
tyrosine | Tyr | Y |
valine | Val | V |
NB : on trouve parfois le tryptophane abrégé en Try au lieu de Trp, mais cela ne fait pas partie des conventions standards.
(Liste non exhaustive)
Nom | 3 lettres | 1 lettre |
---|---|---|
alloisoleucine | all | - |
allothréonine | aThr | - |
ornithine | Orn | - |
sélénocystéine | Sec | U |
pyrrolysine | Pyl | O |
Symboles utilisés lorsqu'un acide aminé n'est pas complètement déterminé.
Nom | 3 lettres | 1 lettre |
---|---|---|
asparagine ou acide aspartique | Asx | B |
glutamine ou acide glutamique | Glx | Z |
leucine ou isoleucine | Xle | J |
Non spécifié ou acide aminé inconnu | Xaa | X |